Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRXP46100 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRXP46100 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRXP46100 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRXP46100 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms