Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA4P43681 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA4P43681 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms