Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PPARGP37231 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PPARGP37231 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms