Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB2P35606 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB2P35606 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms