Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4AP35499 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms