Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms