Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPS1P31327 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPS1P31327 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPS1P31327 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPS1P31327 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CPS1P31327 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms