Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PEX2P28328 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms