Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms