Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMO2P25791 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMO2P25791 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMO2P25791 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMO2P25791 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMO2P25791 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO2P25791 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms