Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTAFRP25105 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTAFRP25105 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms