Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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