Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms