Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR1P18146 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms