Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XRCC5P13010 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XRCC5P13010 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms