Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP3P12645 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP3P12645 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP3P12645 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP3P12645 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms