Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODC1P11926 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms