Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYNP07948 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYNP07948 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYNP07948 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYNP07948 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYNP07948 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms