Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHBP01229 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHBP01229 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHBP01229 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHBP01229 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHBP01229 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHBP01229 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHBP01229 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHBP01229 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHBP01229 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms