Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR1AO95602 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms