Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms