Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMUO75648 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms