Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms