Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY75O60449 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY75O60449 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY75O60449 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY75O60449 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY75O60449 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY75O60449 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY75O60449 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms