Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms