Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXO3O43524 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms