Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCAO15360 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCAO15360 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCAO15360 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCAO15360 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FANCAO15360 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FANCAO15360 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FANCAO15360 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCAO15360 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms