Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP290O15078 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CEP290O15078 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP290O15078 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CEP290O15078 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP290O15078 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP290O15078 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP290O15078 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP290O15078 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP290O15078 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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CEP290O15078 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP290O15078 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP290O15078 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP290O15078 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP290O15078 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP290O15078 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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