Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
APAF1O14727 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APAF1O14727 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APAF1O14727 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APAF1O14727 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APAF1O14727 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms