Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD8O14715 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD8O14715 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms