Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms