Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCP1A6NGW2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCP1A6NGW2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCP1A6NGW2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCP1A6NGW2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCP1A6NGW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms