Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM3A6NDB9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms