Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms