Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms