Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A0A0U1RQF3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms