Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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