Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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USP31Q70CQ4 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP31Q70CQ4 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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