Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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