Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TAF1AQ15573 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TAF1AQ15573 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TAF1AQ15573 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TAF1AQ15573 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TAF1AQ15573 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms