Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PUM3Q15397 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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PUM3Q15397 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PUM3Q15397 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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