Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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