Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms