Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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VAX2Q9UIW0 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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