Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NOP10Q9NPE3 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms