Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXQ1Q9C009 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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