Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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