Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
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