Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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SP140Q13342 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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