Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms